Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms