Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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