Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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