Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms