Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms