Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LTBQ06643 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTBQ06643 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms