Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV1Q03135 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms