Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DSC2Q02487 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms