Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XPCQ01831 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms