Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms