Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA4AP68366 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms