Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB15P59190 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB15P59190 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB15P59190 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB15P59190 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB15P59190 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms