Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSX2P58304 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms