Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCLMP48507 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCLMP48507 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCLMP48507 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms