Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ME1P48163 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ME1P48163 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms