Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP2P42575 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP2P42575 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP2P42575 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms