Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms