Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJC1P36383 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms