Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms