Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRDX6P30041 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms