Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms