Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms