Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTX3P26022 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms