Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFEBP19484 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFEBP19484 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms