Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELFEP18615 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELFEP18615 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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