Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NME1P15531 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NME1P15531 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NME1P15531 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms