Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA4P13612 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms