Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TPM2P07951 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms