Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms