Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F9P00740 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F9P00740 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F9P00740 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms