Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX7O95931 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX7O95931 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX7O95931 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX7O95931 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms