Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms