Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA8SH3BPF8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms