Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BNH8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BNH8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BNH8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms