Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HACD1B0YJ81 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms