Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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