Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVW-1Q9UQF0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms