Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTF2Q9UNY4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms