Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms