Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms