Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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