Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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