Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNAL1Q9UBT7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms