Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL42Q9P2K6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms