Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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