Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PARVAQ9NVD7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms