Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms