Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms