Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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