Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms